Seit der Saison 2015/2016 besteht die Ligenpyramide mit Blick auf die Frauenfußballmannschaften im Fußballkreis Bonn aus acht möglichen Stufen. Die 1. und 2. Bundesliga werden vom Deutschen Fußball-Bund organisiert. Die Regionalliga West liegt in der Verantwortung des Westdeutschen Fußball-Verbandes. Die spielleitende Instanz für die Stufen vier bis sechs – Verbandsliga bzw. Mittelrheinliga, Landesliga und Bezirksliga – ist der Verbandsausschuss für Frauenfußball im Fußball-Verband Mittelrhein. Im Mittelrhein-Oberhaus ist der Fußballkreis Bonn in der Saison 2026/27 mit dem SV RW Merl vertreten. 

In der Landesliga treffen mit dem Bonner SC (Aufsteiger), FV Bonn-Endenich und den Sportfreunden Ippendorf drei Bonner Teams aufeinander. In der Bezirksliga geht neben dem FC Pech auch RW Lessenich an den Start. 

Insgesamt 24 Frauenfußball-Teams aus dem Fußballkreis Bonn verteilen sich auf den Spielbetrieb des Fußballkreises Bonn in der Kreisliga A und B. Spielleitende Stelle für beide Staffeln ist der Spielauschuss des Fußballkreises, dem die Beauftragte für Frauenfußball angehört. Dieses Amt hat seit 2016 Bianca Over inne.